海洋馆包括水族馆、潜水馆和海洋剧场三个主题部分。苏州海洋馆的特色之一，长江和太湖流域淡水鱼类展示。这是国内唯一的以长江和太湖鱼类为主的淡水展示区，有国家一级保护动物中华鲟、长江刀鱼以及太湖内的各种鱼类。 海洋动物展示区内可以看到来自红海、印度洋、南太平洋等全球各大洋的珍稀海洋生物。穿行于长长的圆形透明隧道，仿佛探身海洋，惊喜无限。