祖印寺位于浙江省舟山市城区中心,系舟山市重点文物保护单位。据志书记载,祖印寺原址在衢山岛,旧名“蓬莱院”,创建于后晋天福五年(940年),迄今已有千年历史。宋治平年间赐今额,改名“祖印”。嘉熙年间,邑令余桂迁寺至今址,与原普陀山接待寺合并。元至元年间,高僧山宁开法祖印,继有密庵禅师住持该寺,弘扬禅宗佛法,声誉鹊起,香火鼎盛。
祖印寺曾数毁数兴:明初废县毁寺,香火中断;宣德年间重建,正统年间又遭火焚;成化年间再重建。清初,岛民内迁,城垣尽毁,祖印寺院殿宇亦毁于兵燹,四周房舍无存瓦片寸椽,惟大雄宝殿巍然不动,时人传为神异。康熙年间定海总镇兰理募资修复;同治年间住持僧云岫禅师又募资扩建;宣统年间邑人朱葆三捐资再重修。现存山门、天王殿、大雄宝殿、后大殿、钟楼、东西厢房计有面积二千三百平方米,占地五千多平方米。除正山间系近年重建外,其余皆为清朝建筑。