港沿镇在崇明岛中部偏东，离县城30公里。东部与向化镇相邻，南接堡镇，西接竖新镇，北部与上海警备区富民农场和海军农场连在一起。另有北沿垦区两块，共6000亩。著名的上海市第二社会福利院、大公所天主堂均在镇域之内。