县建市后，称海伦市畜牧局。按照农业部兽医体制改革方案要求，经市政府研究同意，市编委于2007年5月10日下发海编发文件，将海伦市畜牧局正式更名为海伦市畜牧兽医局。属海伦市人民政府，为经济综合管理部门。