南马厂乡在江苏省淮安经济技术开发区东部，北与涟水县、淮阴区以废黄河为界，东与楚州区以大寨河为界。离新长铁路淮安站、239省道、宁连一级公路淮安入口、京沪高速公路淮安入口仅有15分钟路程，到淮安市中心仅需20分钟。