灵芝镇是2001年8月由原灵芝乡和梅山乡合并而成;2002年12月，镜湖新区成立，原齐贤镇15个村划入灵芝镇。灵芝镇在绍兴市镜湖新区核心区块，东临绍三线，西接我国轻纺城，南依绍兴老城区，北接袍江工业开发区，104国道、沪甬铁路、杭甬运河穿境而过，交通十分便捷。灵芝镇现包含41个村，55921人，地域42.8平方公里是绍兴市社会综合实力30强乡镇、浙江省百强乡镇与“珍珠之乡”。