新店镇在翔安区东南沿海突出部，东与南安市石井镇相邻;东南与大嶝及金门岛隔海相望;西南与厦门岛相瞩;西接东咀港;西北、北衔马巷镇;东北与内厝镇相接。翔安区政府在区域内。118.29平方公里，81270人（2004年底）。马（巷）澳（头）、水（头）刘（五店）公路过境。刘五店港为天然良港。建有刘五店文昌鱼保护区。