南阳镇在微山西北部，在独山和南阳二湖的交汇处，东、北与两城镇、鲁桥镇在水中分界，西与侯楼、鱼台县的王鲁镇、谷亭街道、老寨镇相接，南与张楼镇、留庄镇水面相连，东西狭长70余华里。含湖面15万余亩，拥有耕地7200亩，包含三个管区、34个村，30800人，分散居住在湖中83个自然岛屿上。南阳镇古时依运河修建，叫段家行，元朝时建起南阳闸，便以闸名为镇名。