藏巴哇乡在卓尼县境东北端。含地北接渭源县;东接漳县金钟乡;西以洮河与临潭县羊沙乡为界;南与洮砚乡、柏林乡相接。全乡232.1平方公里。平均海拔2300米。现辖6个村委会，20个村民小组。