三个庄子乡在奇台县城以东33公里处，北接五马场乡、南与老奇台镇榆树沟村相接，东与木垒县相邻，西接109团场，处在S303和S228线交汇处，海拔890米，境内地势平坦，土地肥沃、属戈壁井灌区。2014年10月20日，自治区政府（新政函[2014]181号）同意奇台县撤销三个庄子乡，设立三个庄子镇。