马边地处横断山脉东部、四川盆地和云贵高原的过渡地带，马边河纵贯全境，乡镇、村寨沿河座落，犹如串珠摆布，整个马边河流域是一个以山高、坡陡、谷深、切割大为特征的山区县。马边属中亚热带季风气候带，由于地形的特点，立体气候明显，有许多珍稀动植物和名贵土特产资源。马边有全国独一无二的彝族石刻悬托佛；有号称“陆上桂林”的生态休闲地、穿牛鼻及黄连山森林公园，特别是大风顶国家级自然保护区内，有国宝大熊猫和一大批珍稀动植物，还有极具观赏价值的万亩珙桐林，大片杜鹃林以及高山草甸，是一座天然动植物基因库。